分析目的

網(wǎng)絡(luò)藥理學/毒理學+分子對接技術(shù)可以用于探討中藥/化合物，對疾病/健康的作用機制。尋找潛在的治療靶點/毒性靶點。構(gòu)建分子-靶標結(jié)合位點，為理解成分在疾病中的作用提供分子層面的見解。

數(shù)據(jù)來源

ChEMBL、DrugBank、TOXNET、CTD、OMIM、KEGG等公共數(shù)據(jù)庫。

分析方法

利用中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學（TCMSP）數(shù)據(jù)庫、疾病基因數(shù)據(jù)庫（Genecards、OMIM、PharmGkb、DrugBank、TTD）、建立靶點與疾病相關(guān)基因集。使用Cytoscape 軟件構(gòu)建了“成分-靶標”交互式主動網(wǎng)絡(luò)圖譜。基于樞紐基因進行功能富集分析。利用STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)。使用SwissADME工具評估士的寧的藥代動力學（ADMET）特性。使用Autodock Vina進行分子對接，以探索化合物與靶蛋白之間的相互作用。最后，運用分子對接技術(shù)評估化合物與核心靶標的結(jié)合能力。

分析內(nèi)容

獲得相關(guān)成相關(guān)基因的基因集，分析與相關(guān)的潛在靶點、構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò)篩選核心目標、GO 和KEGG 通路富集分析、分子對接。

分析結(jié)果示例圖